Naturparken ligger i nogle markante øst-/vestgående tunneldalsstrøg med grusås-dannelser og mellemliggende moræneflader. Historisk har det ligget på skillelinien mellem de sydvestlige landbrugssletter og de nordvestlige skove i Nordsjælland. Lige nord for fredningerne har der været kraftig udvinding af kalk, teglværksler, grus og sand. Området består af en rig variation af landbrugsland, overdrev, skove, enge, moser, åer og søer.
Hovedparten af Naturparken er fredet eller fredsskov. Der er 8 omfattende fredninger og en række mindre. Af større søer er der Farum Sø, Bastrup Sø og Bure Sø. Hertil kommer de udtørrede søer – Langesø, Kedelsø, Kollensø og Jørlunde Sø.
Naturparken indeholder 8 statsskove: Ryget Skov, Ganløse Orned, Terkelskov, Farum Lillevang, Ganløse Eged, Krogenlund, Uggeløse Skov og Slagslunde Skov. Desuden indgår et lille hjørne af Nørreskoven, som skaber stimæssige forbindelser til Hareskovene og Furesø-området.
Næsten hele Naturparkens akse (Mølleåens tunneldal og omgivelser) er EU Natura 2000-område med følgende udpegningskriterier:
Der er således ikke blot tale om enkeltarter, men 15 forskellige naturtyper, som var typiske i skov, mose, eng og overdrev i det gamle danske landskab. Mange af dem trænges tilbage andre steder af det moderne samfunds anlæg, forurening og effektive landbrug. Her er de bevaret på grund af den afsondrede beliggenhed i tunneldalen og den tidlige fredning.




